唐玄宗生母窦氏是唐太宗生母窦太皇后从兄窦抗的曾孙，祖母是高祖第二女，太宗的异母姐襄阳公主。窦氏是李旦为相王时作为宫人选入相王府的，但是，旦非常喜欢她，与之相爱。当武则天废中宗立旦为睿宗时，窦氏被立为德妃。不过李旦对当皇帝并没有兴趣，只想做一个清静无为的人。所以，他与皇后刘氏、德妃窦氏在一起并不感到寂寞和痛苦。李旦常与窦氏一起读书写字。窦氏生下两女：金仙公主和玉真公主。
垂拱元年(685)，也就是睿宗李旦登基称帝的第二年，窦氏又为李旦生下一子，取名李隆基，也就是后来的唐玄宗。
到了公元690年，武则天改唐为同，自称神圣皇帝，将李旦降为皇嗣，赐姓武氏，迁居东宫，李旦结束了六年的傀儡皇帝生活。
武则天称帝后，李旦虽然改姓武还留在太子之位，但总有朝夕不保的担忧。当时，武承嗣谋取太子位的活动一直没有停止，则天皇帝也多次征求过宰相们的意见，有立武承嗣为太子的意思，后被大臣们劝阻。
长寿二年(692年)元旦，则天皇帝在万象神宫祭拜天地，皇帝初献之后，按例亚献应该是太子李旦，但这次行亚献的却是武承嗣，三献是梁王武三思。太子旦完全被冷落。以此可见，皇帝虽然没有明说，这时已经将皇嗣的天平倾向于武承嗣一边。此时却发生了一件意外的事情。
武则天身边有个户婢叫韦团儿，她非常聪明，深得武则天的信任。韦团儿不满于奴婢的现状，梦想攀上一个有地位的男人，成为他的爱妾。她不顾旦被母帝冷落的处境，却偏偏选中了温厚且有学者风度的李旦为委身对象。团儿三番五次的接近李旦，表示爱慕之情，但由于李旦地位不稳，加上韦团儿是皇帝母亲的亲信，以为是母亲派来监视他的，因此，他极力回避。这使韦团儿受到了难以忍受的屈辱，她决心对太子李旦实施报复。加上这次祭拜事件，皇帝明显冷落太子，韦团儿更加胆大起来。她把报复的对象定在太子妃刘氏和宠姬窦氏身上。
韦团儿事先做好两个桐木人，桐木人的身上印上武则天皇帝的名字，用钉子钉上。买通东宫一个奴婢，悄悄的放到了刘氏和窦氏的床底下。放好后，韦团儿请求皇帝召见，诬告刘氏和窦氏一起，为了折皇帝的寿，每夜在宫中行厌胜之术咒诅皇帝。则天皇帝信以为真，她推测是由于在祭拜时冷落太子，致使二妃对她的怨恨所致。在听到韦团儿诬告后，立即下敕命暗地搜查两位妃子的住室。结果，在二妃的床底下搜出了两个咒诅则天皇帝的桐木人。由此，皇帝没有公开捕杀二妃，将处死二妃的任务交给了韦团儿见机行事。
一天，刘氏和窦氏去皇帝那里请安，两妃从皇帝那里出来后就失踪了。她们既没有回东宫，也没有发现她们的尸体，两位妃子仿佛从人间蒸发。皇帝对此事保持沉默，既不追究，也不追查。
李旦对祭拜之事和两妃失踪之事在人前不敢说半个字，为了保家族的安全，他每天在皇帝御前侍立，就象没有发生任何事情一般，神情泰然自若。甚至还严禁东宫的人私下议论二妃失踪之事。他害怕在东宫有暗探，如果不谨慎，随时都会招致灭顶之灾。他除了保持沉默之外，别无他法。
睿宗于景云元年(710年)复位后，下令在宫中掘地寻找刘妃和窦妃的遗骸，可是，一点痕迹也没有发现。估计当时韦团儿杀害二妃后，将其遗体运到宫外处置。在找不到二妃遗骸的情况下，睿宗在洛阳南郊筑了两座空陵，为两位不幸的妃子举行了盛大的招魂葬礼。追赠两妃为皇后，刘氏为肃明皇后，其陵为慧陵;窦氏为昭成顺圣皇后，其陵为靖陵。
玄宗开元四年(716)，睿宗驾崩，被安葬在桥陵(今陕西蒲城县丰山)。李隆其即位后追尊其生母窦氏为“皇太后”。将其母窦氏与睿宗合葬于桥陵。天宝八年(749)，李隆基又下诏将其母谥号加“顺圣”二字，为“昭成顺圣皇后”。